Le complexe d'espèces R. solanacearum (et diversité génétique)
Le complexe d'espèces R. solanacearum (Fegan &Prior 2005)
Récemment, une analyse phylogénique basée sur différentes approches moléculaires a montré que cette bactérie devrait être appréciée comme un complexe d'espèces ap-partenant à 4 phylotypes relié à des souches d'origines géographiques différentes :
Asiaticum (phylotype I, ex biovars 3, 4 et 5 et ex races 1, 4 et 5),
Americanum (phylotype II, ex biovars 1, 2 et 2T et ex races 1, 2, 3...),
Africanum (phylotype III, ex biovars 1 et 2T et ex races 1, 3) et
Indonesium (phylotype IV, ex biovars 1, 2, 2T et ex races 1, 3).
Diversité génétique de R. solanacearum :classification en phylotype et sequevar
Le polymorphisme des gènes ITS de l'ARNr 16S-23S et hrpB --> phylotype (Multiplex-PCR)
Le polymorphisme des gènes egl, mut-S -->séquévar (Multiplex-PCR et séquençage de gènes)
