Suite à l'identification d'une nouvelle famille d'hôtes en Martinique, un gros travail de caractérisation moléculaire a été réalisé par Emmanuel Wicker du CIRAD. Cette caractérisation a mis en évidence une nouvelle population de R. solanacearum. Grâce à des PCR-multiplex, un nouveau phylotype a été diagnostiqué en Martinique, le phylotype2 sequevar 4NPB appelé « phylotype émergent ».

Voici la répartition géographique des différents phylotypes en Martinique.

Nous avons deux phylotypes : le phylotype 1 et le phylotype 2

Le spectre d'hôte regroupe les solanacées, les cucurbitacées et l'Anthurium.

Sur tomate, la proportion du phylotype émergent est significativement élevée dans le nord atlantique de l'île.

En conclusion : deux populations de R. solanacearum existent en Martinique :

- La population historique qui sévit uniquement sur solanacées.

- La population émergente qui sévit sur solanacées et sur cucurbitacées et sur Anthurium ainsi que sur Héliconia. Cette population montre que R. solanacearum a élargi son spectre d'hotes.

-

Concernant les adventices, il est important de souligner que les adventices peuvent héberger les deux populations de R. solanacearum, sans développer de symptômes typiques. On les appelle des plantes « réservoirs».

Les souches de la population émergente sont plus agressives sur tomate en comparaison aux souches de la population historique et contournent la résistance des variétés commerciales utilisées actuellement en Martinique.

Les 3 principales sources de résistance connues pour développer des variétés tolérantes vis-à-vis de la population historique de à R. solanacearum ne sont plus efficaces contre la population émergente.

Nous n'avons plus de variétés commerciales qui soient tolérantes à R. solanacearum en Martinique.

Sur cette diapo sont présentés les résultats d'une évaluation variétale concernant différentes variétés commerciales de tomate utilisées en Martinique par les agriculteurs. En rouge, il s'agit de notre référence Hawaii 7996, qui correspond à la source de résistance internationale qui est très utilisée dans les programmes de sélection dans le monde. Nous voyons que Hawaii 7996 a perdu son niveau de résistance élevée lorqu'elle est confrontée à la population émergente de R. solanacearum.

Les souches émergentes sont très poplyphages. Elles sont capables d'attaquer un grand nombre d'espèces hôtes alors que les souches historiques sont moins agressives.

Ces souches émergeantes sont probablement endémiques. Elles sont bien implantées dans le milieu naturel, cultivé et non cultivé en bordure de forêt (sur balisier rouge). Elles se maintiennent sur un grand nombre d'espèces adventices, telles Cleome viscosa, Solanum americanum, Portulaca oleracea et Canna indica et bien d'autres.

Les adventices sont très importants car il s'agit d'une source d'infection primaire. Ce sont le plus souvent des porteurs sains sans symptômes.

Ces adventices permettent à la bactérie de survivre et se multiplier en absence de la culture d'intérêt économique. Il est donc important de les éliminer autant que possible des parcelles.

Il s'agit ici de l'Heliconia caribea qui se trouve en bordure de forêt.

Un autre exemple : Solanum americanum, l'herbe amère, une solanacée ;

Nous avons également Cleome viscosa, et Portulaca oleracea