Sur Prunus, les organismes de quarantaine sont de type viral comme le virus de la sharka, le phytoplasme de l'enroulement chlorotique de l'abricotier ou des bactéries comme Pseudomonas syringae ou Xanthomonas campestris, responsable du chancre bactérien. En France, un arrêté ministériel définit les règles de surveillance de la maladie et de lutte en verger et en pépinière. Cet arrêté a été pris en 2011 et a été modifié à deux reprises par la suite. En verger de production, des prospections visuelles sont réalisées avec un gradient plus ou moins important en fonction de la distance par rapport aux foyers détectés les années précédentes. En cas de symptômes douteux, ces prospections visuelles sont doublées d'analyses sur des prélèvements faits en verger ou lorsqu'il s'agit de nouvelles communes contaminées, nous détectons, en général, la souche de virus concernée. Dès qu'un arbre est détecté contaminé, l'arboriculteur doit l'arracher dans les dix jours suivant la notification par le Sral. Et, dans le cas de parcelles contaminées à un taux supérieur à 10 %, voire un taux inférieur en fonction des régions, la parcelle entière doit être arrachée. Cet arrachage devant intervenir, au plus tard, après la récolte ou au 31 octobre de l'année en cours. En pépinières de Prunus, deux prospections doivent être réalisées en cours de végétation pour détecter des symptômes de sharka. Des analyses peuvent également être réalisées de façon aléatoire en pépinière ou sur suspicion, à partir d'un environnement contaminé. En environnement de pépinière, une prospection systématique des vergers et arbres isolés de Prunus est menée dans un rayon d'un kilomètre autour des pépinières deux fois au cours de la campagne. Si de la sharka est détectée en pépinière, plusieurs cas se présentent. Si la détection a été réalisée à moins de 200 mètres de la pépinière, celle-ci perd alors la délivrance du passeport phytosanitaire européen pour la campagne en cours et les deux suivantes. Elle pourra éventuellement le récupérer si aucune contamination nouvelle n'est détectée dans l'environnement. Si, en revanche, la contamination a été détectée à plus de 200 mètres de la pépinière, le passeport phytosanitaire européen n'est pas suspendu dans la pépinière, mais un suivi renforcé sera mis en place par les services officiels. Une détection de contamination en pépinière conduira au retrait du passeport phytosanitaire européen pour toutes les parcelles de pépinière situées à moins de 200 mètres de la contamination, voire à des parcelles plus lointaines si les critères de traçabilité du matériel entre parcelles ne sont pas assurés par l'établissement. Le Sral délègue la prospection en verger aux fédérations régionales de défense contre les organismes nuisibles qui sont en fait les organismes à vocation sanitaire chargés de cette surveillance. Le contrôle des pépinières par des prospections en Languedoc-Roussillon est assurée par le Sral, en revanche, la prospection des environnement sur le kilomètre autour des pépinières est déléguée à la Fredon.