L'analyse et la gestion du risque phytosanitaire : Quels sont les connaissances scientifiques et les outils indispensables ?

Glossaire

A-B
ADN

Acide désoxyribonucléique

Analyse officielle

Le terme « analyse officielle » recouvre au sens du décret « toute analyse par un laboratoire d'un échantillon prélevé dans le cadre d'un contrôle officiel »

Anses

Agence Nationale de Sécurité sanitaire, de l'alimentation, de l'environnement et du travail

C
Chlamydospores

Spore de conservation de certains champignons souvent munie d'une paroie épaisse qui leur permet de subsister d'une année sur l'autre dans le sol ou les débris végétaux en décomposition

Chlamydospores

Spore de conservation de certains champignons souvent munie d'une paroie épaisse qui leur permet de subsister d'une année sur l'autre dans le sol ou les débris végétaux en décomposition.

CIPV

Convention Internationale pour la protection des Végétaux sous l'égide de la FAO

Confinement

Mesure phytosanitaire visant à empêcher la progression d'un organisme nuisible en dehors d'une certaine zone géographique. Un terme équivalent défini par la CIPV est l'enrayement « Application de mesures phytosanitaires dans ou autour d'une zone infestée afin de prévenir la dissémination d'un organisme nuisible ».

Conidies

Spores assurant la multiplication asexuée d'un champignon et ne pouvant se déplacer de façon autonome.

Conidies

spores assurant la multiplication asexuée d'un champignon et ne pouvant se déplacer de façon autonome.

Culture axénique

Qualifie la culture d'un micro-organisme en absence de tout autre organisme ("culture pure")

D
DGAL

Direction Générale de l'Alimentation

Diagnostic

Démarche adoptée pour identifier la ou les cause(s) des symptômes observés

DRAF-SRPV

Direction Régionale de l'Agriculture et de la Forêt – Service Régional de la Protection des Végétaux

E
ELISA

Enzyme-Linked Immuno Sorbent Assay : test de détection immuno-enzymatique basé sur la reconnaissance anticorps-antigène et la visualisation de ce complexe par une réaction colorée

Epuration

Mesure phytosanitaire visant à réduire la prévalence de cas de maladie ou d'organismes nuisibles dans une zone géographique donnée. Un terme équivalent défini par la CIPV est la suppression : « Application de mesures phytosanitaires dans une zone infestée en vue de réduire les populations d'organismes nuisibles.

Eradication

Application de mesures phytosanitaires afin d'éliminer un organisme nuisible d'une zone géographique donnée

Espèces cryptiques

Espèces qu'il est quasiment impossible de différencier entre elles sur la base de critères morphologiques. Cette différenciation entre taxons est quand même possible en se basant sur d'autres critères (différences de physiologie, isolement reproducteur, critères génétiques).

F-H
FAO

Food and Agriculture Organisation (Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture)

FEDON (ou FDGDON)

Fédération départementale de Défense contre les Organismes Nuisibles

FREDON

Fédération Régionale de Défense contre les Organismes Nuisibles (organisme à vocation sanitaire ou OVS)

Hybridation moléculaire

L'hybridation moléculaire est une technique de bactériologie moléculaire qui utilise la propriété d'appariement entre des bases complémentaires des deux brins de la molécule d'ADN et celle des bases de l'ARN avec l'ADN. Elle utilise des enzymes clivant l'ADN à certains sites précis de la molécule double brin.

I
Inoculum

N'importe quelle partie d'un agent pathogène capable d'infecter un hôte.

INRA

Institut National de la Recherche Agronomique. Institut de recherche Français.

ITS

« Internal transcribed spacer » : Espaceur intergénique transcrit.

J-N
LNPV

Laboratoire National de la Protection des Végétaux

Méthodes de géostatistique

Ensembles de méthodes dédiées à l'analyse de données spatialisées constituant une partie des statistiques spatiales. Ces méthodes ont d'abord été développées pour des applications minières.

Multiplexage

Capacité à détecter plusieurs organismes nuisibles dans une même analyse.

NIMP

Normes Internationales pour les Mesures Phytosanitaires (dans le cadre de la CIPV)

O
OEPP

Organisation Européenne et méditerranéenne pour la Protection des Plantes

ONPV

Organisation Nationale de la Protection des Végétaux

OVS

Organisme à Vocation Sanitaire

P-R
PCR

« Polymerase Chain Reaction » : réaction de polymérisation en chaîne de l'ADN. Procédé d'amplification exponentielle in vitro d'une séquence définie d'ADN (acide désoxyribonucléique), faisant intervenir des cycles successifs d'appariements d'oligonucléotides spécifiques (amorces) et d'élongation à l'aide d'une polymérase

Pépinières

Cultures de vigne destinées à la production de racinés ou de greffés-soudés.

Période d'incubation

Durée écoulée entre l'inoculation d'un pathogène et l'expression de symptômes

Période de latence

Durée écoulée entre l'infection et la production de propagules infectieux. En période de latence, une plante infectée n'est donc pas encore infectieuse. La détection d'un organisme pathogène en période de latence n'est généralement pas possible. A ne pas confondre avec la période d'incubation qui correspond au laps de temps écoulé entre l'infection et l'apparition des premiers symptômes. Ces deux périodes ne sont pas nécessairement équivalentes.

Phénologie

La phénologie est l'étude de l'apparition d'événements périodiques dans le monde vivant, déterminée par les variations saisonnières du climat. Dans le cas des insectes, il peut s'agir de l'étude de l'apparition des différents stades de développement en fonction de variables comme la température.

PPE

Passeport Phytosanitaire Européen

Prévalence

Proportion de cas de maladie dans une population à un moment donné. Il ne faut pas confondre la prévalence et l'incidence. L'incidence correspond à l'augmentation du nombre de nouveaux cas par unité de temps (incidence mensuelle, annuelle).

S-Z
SIG

Systèmes d'information géographique : logiciels permettant la gestion, l'analyse, la représentation et la communication de données géo-référencées

Spores

Spore : une spore (grec ancien σπορά, « ensemencement, semence ») est une cellule ou un organe (pluricellulaire) de multiplication végétative ou de reproduction. Il existe plusieurs types de spores, par exemple les conidies sont les spores végétatives des Eumycètes, les basidiospores sont les spores de reproduction sexuée des Basidiomycètes, les ascospores sont les spores de reproduction sexuée des Ascomycètes...

SRAL

Service Régional de l'Alimentation

Stochasticité

Qui a trait à un processus stochastique, c'est à dire aléatoire.

Stratégie de développement r

La stratégie r est une stratégie de développement des populations d'êtres vivants adoptée par des animaux ou des végétaux dont l'habitat est variable ou perturbé, l'approvisionnement en ressources vitales imprévisible et les risques élevés : les espèces misent alors sur la reproduction avec un fort taux de croissance, pour compenser par le nombre. On les appelle des espèces colonisatrices, en expansion ou opportuniste.

Elles ont par conséquentes les caractéristiques suivantes :

1. Fécondité élevée

2. Faible investissement parental dans la survie de chaque descendant

3. Mortalité infantile importante

4. Cycle de vie court

5. Croissance rapide

6. Maturité sexuelle précoce

7. Mortalité adulte importante

8. Faible capacité de compétition

9. Grande capacité de dispersion

Stratégie de développement r

La stratégie r est une stratégie de développement des populations d'êtres vivants adoptée par des animaux ou des végétaux dont l'habitat est variable ou perturbé, l'approvisionnement en ressources vitales imprévisible et les risques élevés : les espèces misent alors sur la reproduction avec un fort taux de croissance, pour compenser par le nombre. On les appelle des espèces colonisatrices, en expansion ou opportuniste.

Elles ont par conséquentes les caractéristiques suivantes :

1. Fécondité élevée

2. Faible investissement parental dans la survie de chaque descendant

3. Mortalité infantile importante

4. Cycle de vie court

5. Croissance rapide

6. Maturité sexuelle précoce

7. Mortalité adulte importante

8. Faible capacité de compétition

9. Grande capacité de dispersion

Suppression

Application de mesures phytosanitaires dans une zone infestée en vue de réduire les populations d'organismes nuisibles.

TAS-ELISA

« Triple antibody Sandwich » - ELISA : test immuno-enzymatique en triple couches

1- Une surface est préparée et une quantité connue d'anticorps dit de capture y est liée.

2- L'échantillon contenant l'antigène est appliqué à la plaque.

3- Après rinçage, les anticorps de détection sont ajoutés

4- Les anticorps conjugués à l'enzyme sont ajoutés.

5- Le substrat convertible par l'enzyme en signal fluorescent est ajouté.

6-Le résultat est analysé avec un spectrophotomètre

UE

Union européenne

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